Биологическое разнообразие бактерий, выделенных из растений с признаками нематодного поражения | Статья в журнале «Молодой ученый»

Отправьте статью сегодня! Несмотря на коронавирус, электронный вариант журнала выйдет 6 июня.

Опубликовать статью в журнале

Библиографическое описание:

Карасёва, Э. В. Биологическое разнообразие бактерий, выделенных из растений с признаками нематодного поражения / Э. В. Карасёва, Ю. С. Кучман, Е. А. Аль-Накиб. — Текст : непосредственный // Молодой ученый. — 2020. — № 15 (305). — С. 9-12. — URL: https://moluch.ru/archive/305/68792/ (дата обращения: 25.05.2020).



В статье авторы пытаются определить взаимосвязь бактерий и нематод, поражающих растения.

Ключевые слова: актинобактерии, протеобактерии, микробиом, МАЛДИ, ген 16S рРНК, Всероссийская коллекция микроорганизмов, нематоды.

C точки зрения разнообразия генофонда и значимости для поддержания гомеостаза биосферы планеты, микроорганизмы превосходят все другие формы жизни на Земле. Между тем, доля изученных видов микроорганизмов ничтожно мала. Актуальность исследования и сохранения биологического разнообразия микроорганизмов подчеркивается рядом правительственных и международных документов последних лет, принятых, в частности, в связи с Конвенцией по биологическому разнообразию. Микробные сообщества, тесно ассоциированные с растениями и животными, являются потенциально богатыми источниками новых видов и родов бактерий.

Выделение и определение актиномицетных сообществ из микробиомов животных актуально в связи с изучением их антибактериальных и прочих свойств, используемых в биотехнологии, включая разработку новых лекарств.

Фитогельминты являются наиболее патогенными для растений организмами. Ежегодно в результате поражения нематодами сельскохозяйственных растений погибает огромное количество ценных пищевых и кормовых культур. Паразитические нематоды снижают товарные качества продукции. Страдает также крупный и мелкий рогатый скот, поскольку происходят тяжелые отравления. Нематодные поражения можно наблюдать повсеместно, поскольку они способны поражать любое растение. Известно, что нематоды ассоциируют с микроорганизмами — грибами, вирусами, бактериями. Особенно часто встречаются организмы актиномицетной линии эволюции (актиномицеты) [1]. Они отличаются наиболее сложной организацией генома и фенотипа. Среди актиномицетов, ассоциированных с нематодами, наиболее изученными являются коринеформные организмы семейства Microbacteriaceae. Бактерии переносятся на хозяйские растения нематодами рода Anguina и могут заселять растительные галлы, индуцированные ангвинами на хозяйских растениях. Детальное изучение этих ассоциаций поможет установить причину образования галлов и поражения растений [2].

В процессе работы проводились экспериментальные исследования по изучению микробного состава образцов пораженных нематодам растений. Примеры пораженных растений изображены на рис.1.

C:\Users\Слава\Desktop\для статьи.bmp

Рис.1. Растения с признаками нематодного поражения

Были выделены чистые культуры микроорганизмов, определены культуральные признаки и проведена идентификация методами MALDI-TOF и анализа нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК. Объектом служили образцы растений с признаками нематодного поражения. Использованные среды: среда для выделения геодерматофилов, среда для выделения метилотрофов, среда R2A, среда с добавлением солода, среда YIM 47, среда Soy. Они были максимально очищены от растительных остатков и гомогенизированы. После культивирования на плотной питательной среде, были изучены морфологические и культуральные свойства. Результаты культивирования изображены на рисунке 2.

ст2.bmp

Рис.2. Результаты культивирования на плотной питательной среде

По результатам MALDI удалось идентифицировать роды Rhodococcus, Rathayibacter, Artrobacter, Frigoribacterium, Microbacterium и Clavibacter, относящиеся к классу Actinobacteria. Штаммы класса Actinobacteria составляют 56 % из общего количества выделенных изолятов из образцов галлов, пораженных нематодами растений Москвы и Московской области. Роды Pseudomonas, Xanthomonas, Methylobacterium, Pantoea из класса гамма-протеобактерии и род Rhizobium из альфапротеобактерий. Филогенетический анализ проводили в программе MEGA. Для анализа использовали нуклеотидные последовательности генов 16S рРНК типовых штаммов известных видов рода Curtobacterium, депонированные в GenBank. Сходство генов 16S рРНК определяли с помощью ресурсов и алгоритмов, имеющихся на сайте EzBioCloud.

Литература:

  1. Чижов В. Н. Фитопаразитические нематоды России. М., 2012. 293 с
  2. Manaia M., Nogales B., Nunes O. Hydromonas duriensis gen. nov., sp. nov., isolated from freshwater // Systematic and Evolutionary Microbiology. 2015. № 65. P. 4134–4139.
Основные термины (генерируются автоматически): нематодное поражение, растение, нематода, результат культивирования, YIM, MEGA, MALDI-TOF, MALDI, плотная питательная среда, среда.


Похожие статьи

Удешевление питательной среды для культивирования...

Проведена сравнительная оценка таких питательных сред как: питательная среда LB, являющаяся одной из основных для культивирования бактерий рода Pseudomonas; питательная среда Кинг В, также применяемая для культивирования бактерий рода...

Исследование роста бактерий на питательных средах...

В статье рассматривается рост микроорганизмов на питательных средах с добавлением полимерного

Результаты иобсуждения. По результатам исследования было установлено, что в чашках

Образец биополимерного импланта служит неблагоприятной средой для роста...

Сравнительная характеристика питательных сред для...

Для сравнительной характеристики, как питательной среды для культивирования кефирных грибков в данном исследование использовалась подсырная

Сравнение обезжиренного молока и подсырной сыворотки, как питательных сред, производилось путем культивирования...

Проблемы стерильности сред и растительных эксплантов...

Колонии бактерий образующиеся на среде как правило активному развитию растений не препятствовали росли на среде медленно

При дистантном воздействии на вторые-четвертые сутки совместного культивирования между мицелием патогена и культурой бактерии...

Условия культивирования перспективного штамма-продуцента...

Установлены условия периодического культивирования штамма-продуцента микробиопрепарата 14-3 Pseudomonaschlororaphis. Оптимальный температурный диапазон для данного бактериального штамма составляет 25-30 °С, кислотность питательной среды – 5-10.

Screening and Identification of New Xyloglucan-Degrading Enzymes in...

MALDI, TOF, ESI, APCI, FAB, ион, анализируемое вещество, метод ионизации, атмосферное давление, лазерное излучение.

Решающим фактором, который влияет на качество MALDI/TOF/MS масс-спектров является. ESI/MS чаще всего используется в сочетании с...

Влияние температуры, фотопериода и концентрации микросолей...

температурный режим, питательная среда, высота растений, количество междоузлий

Основные термины (генерируются автоматически): питательная среда, растение

Температура культивирования составляла 20°С, время — 36 часов, при соотношении массы...

Продуктивность картофеля в культуре in vitro в зависимости от...

Ключевые слова:питательная среда, высота растений, количество междоузлий, микроклубней, температурный режим, регулятор роста.

Наблюдение за ростом и развитием растений показало, что средний прирост высоты растений зависел больше от температурного режима.

Подбор оптимальной питательной среды для разработки...

Обсуждение результатов. Данные по подбору оптимальной питательной среды с целью разработки функциональной кормовой добавки

Как видно из таблицы 1 оптимальной питательной средой для культивирования является вариант № 4, так как в варианте № 1...

Похожие статьи

Удешевление питательной среды для культивирования...

Проведена сравнительная оценка таких питательных сред как: питательная среда LB, являющаяся одной из основных для культивирования бактерий рода Pseudomonas; питательная среда Кинг В, также применяемая для культивирования бактерий рода...

Исследование роста бактерий на питательных средах...

В статье рассматривается рост микроорганизмов на питательных средах с добавлением полимерного

Результаты иобсуждения. По результатам исследования было установлено, что в чашках

Образец биополимерного импланта служит неблагоприятной средой для роста...

Сравнительная характеристика питательных сред для...

Для сравнительной характеристики, как питательной среды для культивирования кефирных грибков в данном исследование использовалась подсырная

Сравнение обезжиренного молока и подсырной сыворотки, как питательных сред, производилось путем культивирования...

Проблемы стерильности сред и растительных эксплантов...

Колонии бактерий образующиеся на среде как правило активному развитию растений не препятствовали росли на среде медленно

При дистантном воздействии на вторые-четвертые сутки совместного культивирования между мицелием патогена и культурой бактерии...

Условия культивирования перспективного штамма-продуцента...

Установлены условия периодического культивирования штамма-продуцента микробиопрепарата 14-3 Pseudomonaschlororaphis. Оптимальный температурный диапазон для данного бактериального штамма составляет 25-30 °С, кислотность питательной среды – 5-10.

Screening and Identification of New Xyloglucan-Degrading Enzymes in...

MALDI, TOF, ESI, APCI, FAB, ион, анализируемое вещество, метод ионизации, атмосферное давление, лазерное излучение.

Решающим фактором, который влияет на качество MALDI/TOF/MS масс-спектров является. ESI/MS чаще всего используется в сочетании с...

Влияние температуры, фотопериода и концентрации микросолей...

температурный режим, питательная среда, высота растений, количество междоузлий

Основные термины (генерируются автоматически): питательная среда, растение

Температура культивирования составляла 20°С, время — 36 часов, при соотношении массы...

Продуктивность картофеля в культуре in vitro в зависимости от...

Ключевые слова:питательная среда, высота растений, количество междоузлий, микроклубней, температурный режим, регулятор роста.

Наблюдение за ростом и развитием растений показало, что средний прирост высоты растений зависел больше от температурного режима.

Подбор оптимальной питательной среды для разработки...

Обсуждение результатов. Данные по подбору оптимальной питательной среды с целью разработки функциональной кормовой добавки

Как видно из таблицы 1 оптимальной питательной средой для культивирования является вариант № 4, так как в варианте № 1...

Задать вопрос