Биологическое разнообразие бактерий, выделенных из растений с признаками нематодного поражения | Статья в журнале «Молодой ученый»

Отправьте статью сегодня! Журнал выйдет 24 апреля, печатный экземпляр отправим 28 апреля.

Опубликовать статью в журнале

Библиографическое описание:

Карасёва, Э. В. Биологическое разнообразие бактерий, выделенных из растений с признаками нематодного поражения / Э. В. Карасёва, Ю. С. Кучман, Е. А. Аль-Накиб. — Текст : непосредственный // Молодой ученый. — 2020. — № 15 (305). — С. 9-12. — URL: https://moluch.ru/archive/305/68792/ (дата обращения: 14.04.2021).



В статье авторы пытаются определить взаимосвязь бактерий и нематод, поражающих растения.

Ключевые слова: актинобактерии, протеобактерии, микробиом, МАЛДИ, ген 16S рРНК, Всероссийская коллекция микроорганизмов, нематоды.

C точки зрения разнообразия генофонда и значимости для поддержания гомеостаза биосферы планеты, микроорганизмы превосходят все другие формы жизни на Земле. Между тем, доля изученных видов микроорганизмов ничтожно мала. Актуальность исследования и сохранения биологического разнообразия микроорганизмов подчеркивается рядом правительственных и международных документов последних лет, принятых, в частности, в связи с Конвенцией по биологическому разнообразию. Микробные сообщества, тесно ассоциированные с растениями и животными, являются потенциально богатыми источниками новых видов и родов бактерий.

Выделение и определение актиномицетных сообществ из микробиомов животных актуально в связи с изучением их антибактериальных и прочих свойств, используемых в биотехнологии, включая разработку новых лекарств.

Фитогельминты являются наиболее патогенными для растений организмами. Ежегодно в результате поражения нематодами сельскохозяйственных растений погибает огромное количество ценных пищевых и кормовых культур. Паразитические нематоды снижают товарные качества продукции. Страдает также крупный и мелкий рогатый скот, поскольку происходят тяжелые отравления. Нематодные поражения можно наблюдать повсеместно, поскольку они способны поражать любое растение. Известно, что нематоды ассоциируют с микроорганизмами — грибами, вирусами, бактериями. Особенно часто встречаются организмы актиномицетной линии эволюции (актиномицеты) [1]. Они отличаются наиболее сложной организацией генома и фенотипа. Среди актиномицетов, ассоциированных с нематодами, наиболее изученными являются коринеформные организмы семейства Microbacteriaceae. Бактерии переносятся на хозяйские растения нематодами рода Anguina и могут заселять растительные галлы, индуцированные ангвинами на хозяйских растениях. Детальное изучение этих ассоциаций поможет установить причину образования галлов и поражения растений [2].

В процессе работы проводились экспериментальные исследования по изучению микробного состава образцов пораженных нематодам растений. Примеры пораженных растений изображены на рис.1.

C:\Users\Слава\Desktop\для статьи.bmp

Рис.1. Растения с признаками нематодного поражения

Были выделены чистые культуры микроорганизмов, определены культуральные признаки и проведена идентификация методами MALDI-TOF и анализа нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК. Объектом служили образцы растений с признаками нематодного поражения. Использованные среды: среда для выделения геодерматофилов, среда для выделения метилотрофов, среда R2A, среда с добавлением солода, среда YIM 47, среда Soy. Они были максимально очищены от растительных остатков и гомогенизированы. После культивирования на плотной питательной среде, были изучены морфологические и культуральные свойства. Результаты культивирования изображены на рисунке 2.

ст2.bmp

Рис.2. Результаты культивирования на плотной питательной среде

По результатам MALDI удалось идентифицировать роды Rhodococcus, Rathayibacter, Artrobacter, Frigoribacterium, Microbacterium и Clavibacter, относящиеся к классу Actinobacteria. Штаммы класса Actinobacteria составляют 56 % из общего количества выделенных изолятов из образцов галлов, пораженных нематодами растений Москвы и Московской области. Роды Pseudomonas, Xanthomonas, Methylobacterium, Pantoea из класса гамма-протеобактерии и род Rhizobium из альфапротеобактерий. Филогенетический анализ проводили в программе MEGA. Для анализа использовали нуклеотидные последовательности генов 16S рРНК типовых штаммов известных видов рода Curtobacterium, депонированные в GenBank. Сходство генов 16S рРНК определяли с помощью ресурсов и алгоритмов, имеющихся на сайте EzBioCloud.

Литература:

  1. Чижов В. Н. Фитопаразитические нематоды России. М., 2012. 293 с
  2. Manaia M., Nogales B., Nunes O. Hydromonas duriensis gen. nov., sp. nov., isolated from freshwater // Systematic and Evolutionary Microbiology. 2015. № 65. P. 4134–4139.
Основные термины (генерируются автоматически): MALDI, MALDI-TOF, MEGA, YIM, нематода, нематодное поражение, плотная питательная среда, растение, результат культивирования, среда.


Ключевые слова

микробиом, актинобактерии, протеобактерии, МАЛДИ, ген 16S рРНК, Всероссийская коллекция микроорганизмов, нематоды

Похожие статьи

Удешевление питательной среды для культивирования...

Проведена сравнительная оценка таких питательных сред как: питательная среда LB, являющаяся одной из основных для культивирования бактерий рода Pseudomonas; питательная среда Кинг В, также применяемая для культивирования бактерий рода...

Исследование роста бактерий на питательных средах...

В статье рассматривается рост микроорганизмов на питательных средах с добавлением полимерного

Результаты иобсуждения. По результатам исследования было установлено, что в чашках

Образец биополимерного импланта служит неблагоприятной средой для роста...

Сравнительная характеристика питательных сред для...

Для сравнительной характеристики, как питательной среды для культивирования кефирных грибков в данном исследование использовалась подсырная

Сравнение обезжиренного молока и подсырной сыворотки, как питательных сред, производилось путем культивирования...

Проблемы стерильности сред и растительных эксплантов...

Колонии бактерий образующиеся на среде как правило активному развитию растений не препятствовали росли на среде медленно

При дистантном воздействии на вторые-четвертые сутки совместного культивирования между мицелием патогена и культурой бактерии...

Условия культивирования перспективного штамма-продуцента...

Установлены условия периодического культивирования штамма-продуцента микробиопрепарата 14-3 Pseudomonaschlororaphis. Оптимальный температурный диапазон для данного бактериального штамма составляет 25-30 °С, кислотность питательной среды – 5-10.

Screening and Identification of New Xyloglucan-Degrading Enzymes in...

MALDI, TOF, ESI, APCI, FAB, ион, анализируемое вещество, метод ионизации, атмосферное давление, лазерное излучение.

Решающим фактором, который влияет на качество MALDI/TOF/MS масс-спектров является. ESI/MS чаще всего используется в сочетании с...

Влияние температуры, фотопериода и концентрации микросолей...

температурный режим, питательная среда, высота растений, количество междоузлий

Основные термины (генерируются автоматически): питательная среда, растение

Температура культивирования составляла 20°С, время — 36 часов, при соотношении массы...

Продуктивность картофеля в культуре in vitro в зависимости от...

Ключевые слова:питательная среда, высота растений, количество междоузлий, микроклубней, температурный режим, регулятор роста.

Наблюдение за ростом и развитием растений показало, что средний прирост высоты растений зависел больше от температурного режима.

Подбор оптимальной питательной среды для разработки...

Обсуждение результатов. Данные по подбору оптимальной питательной среды с целью разработки функциональной кормовой добавки

Как видно из таблицы 1 оптимальной питательной средой для культивирования является вариант № 4, так как в варианте № 1...

Похожие статьи

Удешевление питательной среды для культивирования...

Проведена сравнительная оценка таких питательных сред как: питательная среда LB, являющаяся одной из основных для культивирования бактерий рода Pseudomonas; питательная среда Кинг В, также применяемая для культивирования бактерий рода...

Исследование роста бактерий на питательных средах...

В статье рассматривается рост микроорганизмов на питательных средах с добавлением полимерного

Результаты иобсуждения. По результатам исследования было установлено, что в чашках

Образец биополимерного импланта служит неблагоприятной средой для роста...

Сравнительная характеристика питательных сред для...

Для сравнительной характеристики, как питательной среды для культивирования кефирных грибков в данном исследование использовалась подсырная

Сравнение обезжиренного молока и подсырной сыворотки, как питательных сред, производилось путем культивирования...

Проблемы стерильности сред и растительных эксплантов...

Колонии бактерий образующиеся на среде как правило активному развитию растений не препятствовали росли на среде медленно

При дистантном воздействии на вторые-четвертые сутки совместного культивирования между мицелием патогена и культурой бактерии...

Условия культивирования перспективного штамма-продуцента...

Установлены условия периодического культивирования штамма-продуцента микробиопрепарата 14-3 Pseudomonaschlororaphis. Оптимальный температурный диапазон для данного бактериального штамма составляет 25-30 °С, кислотность питательной среды – 5-10.

Screening and Identification of New Xyloglucan-Degrading Enzymes in...

MALDI, TOF, ESI, APCI, FAB, ион, анализируемое вещество, метод ионизации, атмосферное давление, лазерное излучение.

Решающим фактором, который влияет на качество MALDI/TOF/MS масс-спектров является. ESI/MS чаще всего используется в сочетании с...

Влияние температуры, фотопериода и концентрации микросолей...

температурный режим, питательная среда, высота растений, количество междоузлий

Основные термины (генерируются автоматически): питательная среда, растение

Температура культивирования составляла 20°С, время — 36 часов, при соотношении массы...

Продуктивность картофеля в культуре in vitro в зависимости от...

Ключевые слова:питательная среда, высота растений, количество междоузлий, микроклубней, температурный режим, регулятор роста.

Наблюдение за ростом и развитием растений показало, что средний прирост высоты растений зависел больше от температурного режима.

Подбор оптимальной питательной среды для разработки...

Обсуждение результатов. Данные по подбору оптимальной питательной среды с целью разработки функциональной кормовой добавки

Как видно из таблицы 1 оптимальной питательной средой для культивирования является вариант № 4, так как в варианте № 1...

Задать вопрос